二二八事件爆發後，3月4日林茂生於臺北二二八事件處理委員會發表簡單談話，希望政府要公平、有建設性。3月11日上午，一輛黑色轎車，四名武裝人員及兩名身著中山服的人員至林茂生家，以臺大校長陸志鴻有事相談，被「請」去開會後，便從此失去行蹤。